Formada por dos franjas horizontales de igual proporción; la franja superior es amarilla y significa la riqueza humana y espiritual de los miembros de la Institución: la franja inferior es verde y significa la esperanza de un mejor mañana para todos.

Está cortado por el centro con una diagonal, en proporciones iguales. En la parte superior, sobre un fondo verde que significa esperanza esta dibujado el escudo franciscano, expresión de la unidad de vida de Cristo y Francisco. En la parte inferior sobre un fondo amarillo, que significa riqueza, aparecen los símbolos de los municipios de Armenia, que por espacio de 50 años estuvo el colegio formando en valores cristianos franciscanos y Calarcá, desde donde se levanta con la esperanza de continuar tan magna labor, favor del Quindío y de la patria; así también sobre el libro abierto del conocimiento y la sabiduría aparecen la fecha de fundación del Colegio, 1952; en el centro, procediendo a las dos, la frase SER PERSONA, síntesis de la formación que este claustro se impone.